吐槽
呃啊bioconductor的GRanges包里，setdiff本来是不会去reduce区域的，不知道哪个版本给改成会合并的了，真的服了搞得我一堆核心函数要改。服了我自己写个函数处理吧
R包编写详细教程
最近在写一个R包，遇到了很多的坑，网上几乎没有一个教程能涵盖我遇到的所有问题，因此决定写一个教程。 当然，这不是说网上的教程都不好，网上那些教程都是写一个非常简单的示例，让你很快能够建立一个包，但是我们写包通常不是为了练练手，而是真的有开发的需求的，涉及到的点要比网上的示例和教程都多得多，动不动就会踩坑。所以决定把我踩到的坑都记录下来，方便自己也方便别人。 本文使用的环境是windows10系统Rstudio IDE，因此在写包的时候，需要先安装Rtools才能打包，如果要生成manual.pdf，同时还需要安装Latex的排版引擎，比如 MiKTeX ，本文不详述。还有如果你想写一个使用手册，最好使用RMarkdown，用它可以写出非常漂亮的使用手册，windows系统在Rstudio里可以通过install.packages('rmarkdown')直接安装，linux系统不知道如何安装可以看 Linux配置R markdown 。 本人是第一次写包，有些问题虽然各种查资料解决了，但是可能也没有真正的解决，欢迎各位在评论里批评指正。 写一个R包，大概要经过以下几个步骤： 1）准备一个R包，含有一些必需文件和文件夹。 2）准备R包需要用到的函数和测试数据，并写函数和测试数据的注释。 3）将函数封装成一个包。 4）写说明书。（非必须） 5）将R包上传到github，方便修改和维护。（非必须） 6）补充：遇到问题 以下介绍各个步骤的要点： 1、准备一个R包 在介绍这个之前，需要先了解一下 R包的结构。 我们可以通过Rstudio来获得一个基本的R包模板，模板里就是R包的结构和必需内容。通过Rstudio→File→New Project→New Directory→R package，填写R包名称和创建路径，获得一个名为“myPackage”的R包，里面有以下的文件或文件夹，是一个R包必须有的： myPackage（见图1） | ------ man文件夹：用于存放.Rd文件的文件夹，里面有一个示例文件hello.Rd。 | ------ R文件夹：用于存放R函数的文件夹，里面有一个示例文件hello.R。 | -...
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